Situada en el oeste del Tíbet, entre las montañas Tanggula, las montañas Nyenchen Tanggula y las montañas Gangdise, Naqu tiene unos 1156 kilómetros de largo de este a oeste y unos 760 kilómetros de ancho de sur a norte y una superficie total de 369674 kilómetros cuadrados. Naqu es la prefectura más grande de la Región Autónoma del Tíbet. En su área hay lagos dispersos. A más de 4500 metros sobre el nivel del mar, Naqu es fría, anóxica y seca. Hay unos 100 días de viento fuerte en todo el año, más de 2886 horas de sol, 2,1 grados bajo cero de temperatura media anual y el grado más frío puede alcanzar de 30 a 40 grados bajo cero. Con una precipitación anual de más de 400 mm, de mayo a septiembre es relativamente cálido durante el año. Más condados de Naqu se centran en la cría de animales y varios condados se centran en la semi-pastoreo y semi-agricultura. Por la prefectura pasan el ferrocarril Qinghai-Tíbet, la carretera nacional 109 (Golmud-Lhasa), la carretera Naqu-Changdu y la carretera Naqu-Shiquanhe. Naqu recibió el nombre de “río negro” por el río Naqu, curso superior del río Nujiang, que fluye por la zona. Naqu significa río negro en tibetano. Las carreras de caballos de Naqu, un festival tradicional a gran escala en las praderas del Tíbet septentrional, se celebran desde el periodo Trisong Detsen de la dinastía Tubo hasta la actualidad y tienen lugar cada año a partir del 10 de agosto del calendario gregoriano, con una duración aproximada de una semana.