La prefectura de Shigatse se encuentra en la parte suroeste del altiplano tibetano, entre la cordillera central del Himalaya y la cordillera central de Gangdise-Nyenchen Tanggula, y limita con Nepal, Bután e India. El río Yarlung Tsangpo atraviesa la región, y el monte Qomolangma (Monte Everest), la cumbre más alta del mundo, se localiza en el condado de Tingri. El castillo de Sangzhuzi en Shigatse y el antiguo castillo de Gyantse Dzong fueron centros políticos y educativos. En la zona se encuentran varios monasterios famosos, como el monasterio de Tashilhunpo, el monasterio de Palkhor, el monasterio de Sakya, y varios puertos, como el puerto de Yadong, el puerto de Zhangmu y el puerto de Kyirong. Los seis valles famosos en el pie sur del Himalaya en Shigatse se conocen como "Pequeña Jiangnan en el Tíbet" (Jiangnan, las regiones al sur de las cuencas media y baja del río Yangtsé): el valle de Yadong, el valle de Chentang, el valle de Gama, el valle de Rongxia, el valle de Zhangmu y el valle de Kyirong.